외안F-004 |
눈물 및 눈물샘의 단백질 프로파일 분석을 이용한 건성안 생물표지자의 분석 |
연세대학교 의과대학 안과학교실 시기능개발 연구소(1)
연세대학교 의과대학 안과학교실 각막이상증 연구소(2)
한림대학교 의과대학 춘천성심병원 안과학교실(3)
경희대학교 응용과학대학 응용화학과 기능시스템생화학연구실(4) |
이철희(1), 황호식(3), 정재훈(4), 김광표(4), 이형근(1)(2) |
목적 : 눈물 및 눈물샘에서 얻은 시료의 단백질 프로파일을 비교 및 분석하여 적합한 건성안 생물표지자를 찾고자 하였다.
방법 : 정상안 5안과 건성안 5안의 눈물 및 눈물샘에서 시료를 얻은 후 원심분리를 통해 단백질을 분리시켰다. 획득한 시료를 트립신을 이용하여 펩티드로 분해한 후 액체 색층 분석 매스 분석법(LC-MS/MS)을 통해 동정된 펩티드에 대한 분석을 진행하였다. 맥스퀀트(Maxquant) 데이터베이스를 이용하여 동정된 단백질의 생물학적 기능별로 분류하여 정리하였으며 알려진 단백질의 기능과 유사성을 Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins(STRING)을 이용하여 분석하였다. 또, 건성안에서 정상안에 비해 통계적으로 유의하게 증가되거나 감소된 단백질을 분류하여 분석하였다.
결과 : 눈물 시료에서 총 1689가지의 단백질이 검출되었으며 눈물샘에서는 총 1429가지의 단백질이 검출되었다. 눈물에서 검출된 단백질 중 건성안에서 정상안에 비해 증가된 단백질은 297가지였으며 감소된 단백질은 86가지였다. 눈물샘에서 검출된 단백질 중 건성안에서 증가된 단백질은 169가지였으며 감소된 단백질은 45가지였다. 이 중 건성안 눈물 샘플과 눈물샘 샘플 모두 공통적으로 증가된 단백질은 81가지였으며 공통적으로 감소된 단백질은 5가지였다. 건성안 군의 눈물과 눈물샘에서 외부물질에 대한 반응, 염증반응 및 상처 회복에 연관된 단백질이 증가되었다.
결론 : 본 연구를 통해 눈물 및 눈물샘에 다양한 단백질을 검출하였으며 건성안에서 증가되거나 감소되는 단백질의 조성 및 생물학적 기능을 확인하였다. 이는 추후에 적합한 건성안 생물표지자를 찾기 위한 기반이 될 것이다.
|
|